fix: 修正 WaterFlow Skill/Tool 兼容性问题 + 类型声明完善

Skill 格式修正:
- allowed_tools → allowed-tools (kebab-case)
- user_invocable → user-invocable (kebab-case)
- persona skill name: graph_memory_persona → persona (匹配目录名)
- task skill name: graph_memory_task → task (匹配目录名)

Tool 接口优化:
- installTrulyMEM: require() → ESM dynamic import
- handler: 添加 abort 信号检查
- graph_database: _platform 类型 any → Platform
- graph_database: 修复 fs null 检查和 ArrayBuffer 类型转换

类型声明完善:
- waterflow.d.ts 从 193 行扩展到 400+ 行
- 添加 SchemaType, ToolFeatures, ToolMetadata 等完整类型
- 添加 network, tools, builtinTools 等缺失字段
- 添加 waterflow/runtime/core/tools/builtin 模块声明
- 添加 waterflow/runtime/core/tools/tool_registry 模块声明

清理:
- 删除 TRACKING.md, 重构.md, migration_plan.md, todo_progress.md
- 删除 docs/integration/waterflow-design.md

ts/bundled-skills/graph_memory/SKILL.md

@@ -3,7 +3,7 @@ name: graph_memory
 description: 图记忆工具 - 让 AI 拥有真正的长期记忆能力
 when_to_use: 需要 AI 记住、回忆、管理信息或任务时
 context: inline
-allowed_tools:
+allowed-tools:
   - builtin:graph_memory
 arguments:
   - name: action
@@ -15,7 +15,7 @@ arguments:
     type: object
     required: true
     description: 操作参数
-user_invocable: true
+user-invocable: true
 ---
 
 # GraphMemory 图记忆操作

ts/bundled-skills/graph_memory/persona/SKILL.md

@@ -1,9 +1,9 @@
 ---
-name: graph_memory_persona
+name: persona
 description: 管理 AI 人设 - 更新或清除 AI 角色特征
 when_to_use: 需要修改 AI 的角色设定或清除人设时
 context: inline
-allowed_tools:
+allowed-tools:
   - builtin:graph_memory
 arguments:
   - name: action
@@ -22,7 +22,7 @@ arguments:
   - name: confirm
     type: boolean
     description: 确认清除 (用于 clear)
-user_invocable: true
+user-invocable: true
 ---
 
 # GraphMemory Persona 人设管理

ts/bundled-skills/graph_memory/task/SKILL.md

@@ -1,9 +1,9 @@
 ---
-name: graph_memory_task
+name: task
 description: 管理连续性任务 - 创建、更新、删除任务节点
 when_to_use: 需要创建或管理长期任务时
 context: inline
-allowed_tools:
+allowed-tools:
   - builtin:graph_memory
 arguments:
   - name: action
@@ -28,7 +28,7 @@ arguments:
   - name: info_node
     type: string
     description: 信息节点 (用于 link_info)
-user_invocable: true
+user-invocable: true
 ---
 
 # GraphMemory Task 任务管理